本发明提供了一种基于图的跨机柜更新方法、系统及可读存储介质，方法包括以下步骤：S1、构建关系图辅助数据放置，其中，在关系图中，点表示数据块，边表示数据块之间的关联，点权表示数据块的访问热度，边权表示两个数据块之间的关联程度；S2、在关系图中找到一组数据块，使这组数据块内部的边权之和达到最大并组织为条带；S3、将条带中相关性最强的一组数据块放在同一个机柜中，并保证各个机柜点权之间的差异最小；S4、构建并行树，在并行树中，节点代表机柜，边代表机柜之间的网络链路。本发明通过用关系图辅助数据放置，能够减少I/O操作次数和跨机柜传输量。并且，通过构造并行树选择最近的网络传输路径，减少了网络传输延时。