本发明公开了一种基于太赫兹的铁轨表面损伤检测方法、系统和存储介质，可应用于工件损伤检测技术领域。本发明方法包括以下步骤：获取网口相机采集的铁轨点数特征数据；对所述铁轨点数特征数据进行点云分割，得到铁轨显性点云特征数据和需要重构点云特征数据；根据所述铁轨显性点云特征数据和所述需要重构点云特征数据进行铁轨表面损伤检测。本发明通过对网口相机采集的铁轨点数特征数据分割后，根据分割得到铁轨显性点云特征数据和需要重构点云特征数据进行铁轨表面损伤检测，从而无需接触式设备进出图像采集，同时利用点云分割的特性，提高特征数据的分割精度，从而提高铁轨损伤检测的准确度。