本发明提出一种基于容器判断的指纹验证管理方法,包括：建立双系统云安全手机；在手机Linux内核部署LXC容器，基于LXC容器建立双容器系统；两个容器系统共用一个指纹驱动；并在宿主机建立一个指纹触摸事件onfingerTouchEvent；在宿主机进行当前容器系统判断；并通过所述指纹触摸事件onfingerTouchEvent将指纹验证信息发给当前容器系统；当前容器系统将指纹验证信息与储存的指纹数据进行对比检验。本发明通过先一步的容器判断，保证了两个容器的指纹驱动隔离验证，有利于双系统手机的安全性和可靠性。