本发明公开了一种用于农业危害物的高通量可视化检测装置和方法。装置包括：芯片膜盘用于农业危害物的富集与显色；交互模块用于显示图像采集结果和分析结果以及开关指令的输入；处理器模块用于接收图像采集结果并分析，并接收指令进行控制。方法包括：将待检样本和显色探针发生显色反应，采集显色后的芯片图像并传输至处理器模块，处理器模块根据图像处理方法计算获得图像分析结果，进一步计算获得待检样本中的农业危害物的种类和浓度。本发明实现了农业生产中过程中多种农业危害物的同时可视化检测，具有体积小，操作简单，检测速度快和高通量等特点，降低了对大型检测仪器和专业操作人员的依赖，在现场快速检测方面具有广阔的应用前景。