本发明公开了一种基于离差最小化算法和博弈论联盟收益分配方法，该方法针对新能源配储模式下可再生能源发电商合作联盟在收益分配时没有考虑发电商的个体差异和独特性的问题，选取联盟收益贡献率、资源稀缺性、不可替代性以及联盟收益依赖性4个指标，量化不同发电商对联盟的贡献程度，凸显发电商的个体差异和独特性；进一步地，为避免单一指标的片面性，尽可能考虑各成员的不同诉求，采用考虑各参与主体利益均衡的离差最小化法来确定各指标的权重，并构建基于离差最小化算法的联盟收益综合分配方法。本发明能形成可再生能源发电商合作联盟收益分配的合理模式，使分配方式有理有据，达成各联盟成员对分配方式的认同。