本发明提供一种配置保安段的换流站站用电系统接线及运行方法，换流站站用电系统接线包括多个负荷中心以及第一供电段、第二供电段、第三供电段、保安段，第一供电段、第二供电段、第三供电段并联，第三供电段通过一三联络断路器与第一供电段连接，第三供电段通过二三联络断路器与第二供电段连接，每个负荷中心包括多个工作母线以及一个备用母线，多个工作母线之间通过断路器连接，备用母线通过断路器与一个工作母线连接，第一供电段、第二供电段通过干式变压器分别与每个负荷中心的所有工作母线连接，保安段通过断路器与每个负荷中心的备用母线连接。该换流站站用电系统接线能够在供电段失电和/或变压器退出工作时保证换流站内基本运行状态。