本发明提供一种耐蚀纳米孪晶镍基合金及其制备方法和应用，所述耐蚀纳米孪晶镍基合金的微观结构包括纳米孪晶晶粒和再结晶晶粒，所述纳米孪晶晶粒占所述耐蚀纳米孪晶镍基合金的体积分数80％以上，所述再结晶晶粒占所述耐蚀纳米孪晶镍基合金的体积分数小于20％；所述制备方法通过将镍基合金铸锭依次进行均匀化处理、热轧、冷轧和退火热处理，得到了同时具有优良的耐蚀性和优异的综合力学性能的耐蚀高强韧的纳米孪晶镍基合金。本发明所述耐蚀纳米孪晶镍基合金的制备工艺简单易控、加工成本低、产品尺寸大，适合作为复杂高浓碱性工业生产环境中的耐蚀结构材料。