本发明公开了一种桥墩裂缝的生物加固和防腐蚀工艺，包括：S1、采用南海钙质沙进行钙离子提取得到氯化钙溶液；S2、在发现裂缝的桥墩处，安装反应套管模具反应装置，将南海钙质砂颗粒分三次装入桥墩和模具反应装置间的空隙，并分批注入细菌液、加入尿素和步骤S1得到的氯化钙溶液进行循环灌注，并重复循环灌注过程。本发明通过采用南海钙质沙提取得到的氯化钙溶液与细菌液循环浇灌，能实现对桥墩裂缝的生物加固，使得与桥墩基体材料的协调性、渗透性更好，可以深入最微小的裂缝，生成的碳酸钙晶体可以有效地和桥墩基体材料更好的结合，起到了填充裂缝和粘结裂缝的作用，且具有成本低，取材方便，副产物少且安全，不会对海洋环境造成污染优点。