本发明提出了基于孔底自发电激发的煤层水平长钻孔增透系统，水平长钻孔由钻进系统钻出，钻进系统包括钻进电机、与钻进电机相连的钻杆、以及与钻杆相连的钻头，钻杆中空设置，钻杆中安装有自发电装置、以及随钻头前进的增透装置，自发电装置与增透装置电连接且为增透装置供电。本发明对钻杆进行改进，将自发电装置和增透装置安装在钻杆中，利用钻杆将增透装置和自发电装置送入水平长钻孔中，自发电装置通过钻杆内置电缆线，避免了在水平长钻孔内大量使用电缆线的复杂工艺，自发电装置为增透装置供电，可在钻水平长钻孔的同时进行增透作业，沿着水平长钻孔致裂周边煤体，增强煤层透气性，提高煤层气井的产量。