一种用于水冷却系统的故障监测方法及系统，包括：步骤1，基于水力计算当量阻力法，拟合流量实际变化率与压力差实际变化率之间的关系，得到压力差变化率的预测模型；步骤2，将压力差实际变化率输入压力差变化率的预测模型中，得到流量预测变化率；步骤3，在预设时段内，获取流量预测变化率与流量实际变化率的流量差值，根据流量差值与设定阈值的大小关系确定水冷却系统中设备的健康度。本发明考虑系统成本，利用其它传感器的测量值，通过理论计算分析，达到使用已有传感器辅助检测其他传感器的故障情况，达到检测传感器和变送器健康状况的目的。