本发明关于一种病原微生物大规模暴发提前预测预警方法，针对固定位置的生活污水监测，获得病毒含量数据；对数据进行滤波清洗和差值处理；对不同斑块内病毒动力学传播模型参数进行估算；对病毒斑块间传播特征进行估算；构建优先管理办法和二维风险管控图；融合不同斑块内病毒动力学传播模型参数、病毒斑块间传播特征及优先管理办法，展示病毒在一个大的斑块集合内的动态增长和消亡过程，预测传播趋势。融合斑块内和斑块间传播模型，对于大规模暴发可以提前4‑6周预测和预警，并发现可出现持续暴发的社区，根据病毒在不同区域中的传播特性指标，对不同区域进行风险排序，优化社会防控资源的分配。