本发明公开了一种升船机高耸塔柱与高架通航渡槽变形协调连接方法。它包括在升船机高耸塔柱与高架通航渡槽连接处设置滑动铰支座和止水结构；确定滑动铰支座的滑动摩擦系数μ，使滑动铰支座在风荷载和小震荷载作用下无位移；确定止水结构沿高架通航渡槽水流方向的宽度L，使止水结构在风荷载和小震荷载作用下不被破坏；确定连接处滑动铰支座在中震荷载作用下横向允许的最大滑动位移dm，使滑动铰支座在中震荷载作用下不被破坏；确定使滑动铰支座被破坏的最小剪力F，使滑动铰支座在大震荷载作用下被破坏，避免高架通航渡槽发生破坏。本发明避免通航渡槽因受到较大的横向剪力而产生破坏并造成安全事故。