本发明公开了一种基于河道断面地形的多流路河道平滩流量确定方法，首先建立多流路河道平滩特征值表征体系及其量化方法；基于地形平稳性过渡原则，建立断面地形插补以及标准化网格划分方法；基于水位逐步增大法构建平滩特征值提取模型，建立潜在平滩特征值数据集；基于宽深比极值法和年际间平滩特征值连续性假定原则，建立分级平滩特征值确定方法；基于水位—流量关系，建立基于河道断面地形的多流路河道平滩流量确定方法。本发明考虑了多流路河道特殊滩槽形态以及人工设施的影响，能够解决多流路河道存在多级滩地时平滩水位难以确定的问题，为多流路河道防洪、河道整治及生产实践活动提供技术支撑。