一种变电站系统配置描述文件的配置方法及装置，该方法包括：获取SSD文件；根据SSD文件，按间隔建立变电站一次设备列表；根据变电站一次设备列表，建立同间隔下各二次设备IED与相应的一次设备关系列表；根据同间隔下各二次设备IED与相应的一次设备关系列表，建立同间隔下各相互作用的二次设备IED关联关系列表；根据同间隔下各相互作用的二次设备IED关联关系列表和间隔信息，建立同间隔下各关联二次设备IED虚端子类型连接关系和间隔序号；根据同间隔下各关联二次设备IED虚端子类型连接关系和间隔序号，配置各二次设备IED虚端子连接。通过本发明实施例提供的方法及装置，可实现快速对SCD文件过程层连接自动配置，提高了智能变电站SCD文件维护效率以及可靠性。