本发明提供一种流量测试系统及其方法，包括：待测活塞装置，设有将待测活塞装置的腔体分隔为工作腔以及收集腔的第一活塞；被检表，设有与工作腔的侧壁第一排气口管路连接的第二进气口；补偿活塞装置内由第二活塞形成补偿腔设置的第三进气口和被检表的第二排气口管路连接，补偿腔的第三排气口通过管路连接收集腔的第一进气口；控制器，用于在工作腔的气体压力变化量大于预设阈值时，控制第二活塞移动以调整补偿腔的容积使工作腔内的气体压力变化量小于预设阈值。本发明中，在待测活塞装置的工作腔的压力变化量较大时，通过调整补偿活塞装置中补偿腔的容积调整工作腔的气体压力变化量，使得工作腔内的气体压力趋于恒定，提高了流量测试的准确性。