本申请涉及一种活化煤矸石基压缩生态土及其制备方法，属于固废资源化利用技术领域；包括：微生物活化煤矸石、矿物吸附剂、吸水树脂和生物粘合剂；其中，微生物活化煤矸石为化学活化煤矸石经生物好氧发酵制得，生物发酵的原料包括：化学活化煤矸石和复合菌剂；化学活化煤矸石为煤矸石经硝酸氧化处理制得；复合菌剂包括鲁菲不动杆菌、胶质芽孢杆菌和蜡状芽孢杆菌的混合物；以微生物活化煤矸石为原料，微生物活化煤矸石是煤矸石经过化学和微生物双重活化处理制得的，使得煤矸石中的养分转化为更易被植物吸收的营养物质，使得煤矸石颗粒中的固化有机质转化为可供植物吸收利用的腐殖酸，达到改善目前煤矸石中有机质固化程度高的目的。