本发明提供一种生物基水溶性热熔胶的制备方法，采用高温高压溶液法，将尼龙盐、分子量调控剂加入去离子水中反应制备得到所述聚酰胺热熔胶；所述高温高压溶液法包括高压段‑常压段两个反应阶段，通过所述分子量调控剂调控分子链中醚键和氧原子数量，使水分子易于和醚键、酰胺键形成氢键，所述聚酰胺热熔胶具有亲水性。通过采用本发明的技术方案，选用含有醚键二元酸化合物与二元胺化合物反应制备聚酰胺，通过对尼龙分子链中醚键以及氧原子含量的调控，赋予尼龙水溶性的同时，反应原料简单，无需进一步纯化，避免传统聚醚二胺与二酸反应制备的尼龙制品纯化困难和储存不稳定等问题。