本发明公开了一株耐盐异养硝化‑好氧反硝化细菌及其应用。耐盐异养硝化‑好氧反硝化细菌Halomonas elongate 5300，保藏编号：CGMCC No.25768。该菌株盐浓度耐受范围广，能够在0％～26％盐浓度下生长，在盐浓度4％～16％时，能高效去除水体中的NO2‑‑N和NH4+‑N，其中NO2‑‑N去除效率达到100.00％，NH4+‑N超过78.51％以上。菌株5300能够有效解决以往生物脱氮过程中高盐对含氮污染水体的功能微生物的活性抑制问题，适用于高盐、好氧条件下进行含氮污染水体的脱氮处理。