本发明公开了一种基于母线等值参数的母线低容抗保护方法及系统，包括：获取母线的三相电压相量值和母线中每条支路的三相电流相量值；基于母线中每条支路的三相电流相量值确定三相母线差动电流；对母线的三相电压相量值进行修正，获取三相电压修正值；基于所述三相母线差动电流和三相电压修正值，确定每一相对应的母线对地容抗；对于任一相，基于该任一相对应的母线对地容抗和三相母线差动电流按照预设保护判据进行保护。本发明通过母线区内故障时对地容抗等值参数的显著降低识别母线故障，由于母线对地容抗为母线等值参数，因此不受系统运行方式的影响，可以在大幅提升差动保护灵敏度的同时，保证保护可靠性，提升系统的安全稳定运行水平。