本发明公开了一株海水鱼益生菌乳酸乳球菌菌株及其用途。该菌株为乳酸乳球菌(L.lactis)M48，保藏编号为：GDMCC No:62621。体外实验证明：乳酸乳球菌M48与海鲈虹彩病毒(SPIV)感染的海鲈细胞共培养，具有体外抗SPIV在海鲈细胞增殖的特性；乳酸乳球菌M48对海水鱼创伤弧菌、哈维氏弧菌、溶藻弧菌、海豚链球菌、柠檬酸杆菌和气单胞菌也具有抑制作用。动物实验证明：乳酸乳球菌M48对海鲈具有免疫调节和增强免疫功能的特性，且M48菌株单独饲喂对海鲈也具有抗SPIV感染的特性。本发明的乳酸乳球菌M48在海水鱼抗病毒、抗病原菌方面以及免疫调节和增强海水鱼免疫功能方面有一定的应用前景。