一种适用于综合矢量误差评估的同步相量装置数据自动处理系统及其处理方法，设置有数据文件库、人机界面、数据解析模块、项目类别和参数配置模块、测量值模块、理论值生成模块、误差计算模块、TVE指标数据库和结果判断模块。该系统采用文件导入的方式获取测量数据，解决了通信协议互操作性的限制；通过规范的数据文件名称，实现理论值自动生成、PMU测量值的自动解析以及TVE结果的自动判断，实现了采用综合矢量误差评估方式对测量数据进行自动处理和结果判断。本方案已经在同步相量装置的综合矢量误差计算中得到应用，填补了技术空白，采用自动判断方式，减少了工作量，提高了数据处理效率。