本发明公开了一种新能源机组次同步振荡抑制方法、装置及存储介质。其中，方法包括：按照预设时间间隔对新能源机组的输出振荡电流进行频谱分析，获取次同步频段电流的次同步振荡幅值及频率；当次同步振荡幅值超过预先设置的幅值阈值的情况下，根据次同步振荡频率对输出振荡电流进行自适应滤波，获取次同步振荡波形；根据次同步振荡波形，在调相机的励磁系统附加相应的控制，使得调相机对新能源机组输出的同频反相的抑制电流；根据次同步振荡波形的过零点对抑制电流的抑制波形的抑制频率、抑制相位进行修正，确定反向抑制电流。在振荡波形的每个过零点，对抑制波形的频率、相位进行修正，实现振荡抑制的优化。