本发明公开了一种基于肿瘤高光谱图像的肿瘤分类方法及系统，该方法包括：获取肿瘤组织的高光谱图像和环境光高光谱图像，提取环境光光谱特征和肿瘤高光谱图像数据；对肿瘤高光谱图像数据进行数据预处理，获取肿瘤高光谱图像数据集；以标注肿瘤类型的肿瘤高光谱图像数据集为训练集，训练肿瘤分类模型；该肿瘤分类模型包括良恶性分类模型、良性分类模型和恶性分类模型，每种分类模型均包含多个采用不同分类算法的模型，通过赋权分类输出最终的分类结果；将待分类肿瘤高光谱图像输入训练完成的肿瘤分类模型，输出肿瘤分类结果。本发明根据肿瘤高光谱图像数据，利用构建的综合不同分类算法的肿瘤分类模型进行肿瘤分类，实现分类效率和准确性的提高。