本发明公开了一种花生根瘤菌株系HM13及其应用，花生根瘤菌株系HM13的分类命名为根瘤菌，拉丁学名为Rhizobium sp.，已于2022年12月27日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，其保藏编号为CGMCC No.26342，保藏单位地址为北京市朝阳区北辰西路1号院3号。属于根瘤菌Rhizobium sp.属的新种，具有分泌吲哚乙酸IAA、固氮促长、降低花生植株和籽粒中的Cd含量的功能。可促进花生生长，增加花生植株氮含量和生物量，使镉污染农田中花生籽粒产量提高70%、镉含量降低50%。