本发明公开了一种三电平直流变压器中点电位控制回路、方法及系统，所述方法包括获取C1、C2和C3两侧的电容电压UC1、UC2、UC3；将UC3与预设电压值的差值作为输入，经过PI控制器输出得到外移相角；将所述UC1、UC2的差值输入PI控制器，并根据所述外移相角的正负关系，计算获得Q1和Q4的占空比；将所述Q1和Q4的占空比以及外移相角输入预设的脉冲发生器模块，得到所有开关管的触发脉冲信号；将所述触发脉冲信号传输至各开关管，实现三电平直流变压器的中点电位控制，本发明在空载，轻载，满载状态下均可以实现中性点电位的有效调节解决变压器在空载或轻载时中性点电位控制效果较差的问题。