本发明公开了一种黄瓤耐裂高糖小西瓜新种质的创制方法，所述创制方法包括：通过选择特定性状的母本和父本进行杂交，之后通过抗病分子标记、皮韧的选择以及糖度的测定等手段，对F1代自交后的F2代进行育苗、定植并从中选择特定的单瓜杂交后得F3代，F4代至F6代自交筛选纯种，最终从F6代中筛选出纯化的黄瓤耐裂高糖小西瓜新种质材料。该方法筛选出纯化的黄瓤耐裂高糖小西瓜长势稳健，且高抗枯萎病，糖度较高，口感非常好，可用做于选育黄瓤耐裂高糖小西瓜新品种的核心亲本。