本发明提供了一种无人值守自动气象站雨量数据质控方法及系统，涉及数据处理领域，包括：获取雨量监测数据；对第i个翻斗式雨量计进行固定误差分析，获取起始误差分析结果；获取第一变量误差分析结果；获取第二变量误差分析结果；对所述雨量监测数据进行误差拟合，获取雨量监测数据拟合结果；根据雨量监测数据拟合结果对N个翻斗式雨量计的第一时刻的N个雨量监测数据拟合结果进行偏离度分析；若偏离度分析结果满足预设要求，将雨量监测数据拟合结果设为质控合格数据，上传至雨量监测日志存储器。解决现有技术中由于仪器内部结构、外部高影响因素等噪音干扰影响，导致雨量监测信息准确度较低的技术问题。