本发明公开一种蛋白质结构预测方法、模型训练方法、装置、设备及介质，涉及生物信息、深度学习和计算机应用技术领域，蛋白质结构预测模型的训练方法包括步骤：获取包括已知的蛋白质序列和氨基酸残基的理化性质的训练数据集；根据蛋白质序列生成含有蛋白质序列信息的第一特征向量；对氨基酸残基的理化性质进行聚类，并根据聚类后的氨基酸残基的理化性质生成含有氨基酸残基理化信息的第二特征向量；利用第一特征向量和第二特征向量，对特征提取网络和结构预测网络进行训练，得到蛋白质结构预测模型。本发明提供的蛋白质结构预测模型的训练方法，无需复杂的模型进行输入特征的提取，计算速度快，有效节省了蛋白质预测模型的训练时间。