本发明属于基因工程技术领域，公开了拟南芥ABAPT3蛋白或其相关的生物材料在提高植物抗病毒性能中的应用。ABAPT3蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明通过过表达植物去棕榈酰化酶ABAPT3，该蛋白通过特异性抑制双生病毒C4蛋白的棕榈酰化修饰，从而抑制致病因子C4的功能和双生病毒侵染。由于双生病毒的C4蛋白具有蛋白序列和功能的保守性，且大多数的双生病毒的C4蛋白都具有棕榈酰化修饰位点，因此该技术可能可以广泛应用于其他双生病毒种类，以提高农作物抵抗双生病毒的能力。