本发明属于制药生产技术领域，特别涉及一种离子置换膜反应器清洁化制备L‑门冬氨酸镁的方法及装置，所述方法采用离子置换膜反应器，包括以下步骤：按照设定的排列方式布置离子置换膜反应器中的膜堆排列；基于膜堆排列，向原料室1通入硫酸镁溶液，向原料室2投入L‑门冬氨酸铵溶液，向产物室1和产物室2通入去离子水，向阳极室和阴极室通入硫酸钠溶液；在离子置换膜反应器两端施加直流电按照设定模式进行反应，反应后在产物室1中得到目标产物L‑门冬氨酸镁。同时在产物室2中还可得到硫酸铵副产品，提升了工艺过程的经济效益，具有重要的工业应用价值。