本发明提供了一种变电站有机废水生物处理方法及处理装置，包括以下步骤：S100分离出粪便固体和粪便液体，输送粪便液体至预装有发酵垫料和有益菌种的生物发酵罐，输送粪便固体至底泥发酵罐；S200：供送粪便液体及氧气至生物发酵罐，发酵完成后对生物发酵罐进行抽真空负压操作，得到发酵肥料和发酵底泥；S300：对发酵垫料和发酵底泥分别进行压滤，获得有机肥料。本发明提供的变电站有机废水生物处理方法，能够将有机物含量较高的生活污水分为厨余清洗废水和粪便废水分别进行输送以及处理，厨余清洗废水采用生化处理，粪便废水分离为粪便固体和粪便液体后分别进行发酵处理，提高了发酵效率，实现了污水的有效回用，减少了水资源的浪费。