本发明涉及一种功能基因的检测方法，具体为硫酸盐还原菌代谢酶功能基因检测方法。根据硫酸盐还原菌代谢酶的特异性序列设计三条不同发卡状DNA链，三条不同发卡状DNA链混合后加入待检测样品进行孵育，孵育后向体系内加入血红素(hemin)和TMB以及H2O2进行反应，通过显色反应对待测样品中硫酸盐还原菌的关键代谢酶DNA进行定性/定量的检测。本发明的制备方法操作简单，反应快速，肉眼可见。硫酸盐还原菌代谢酶功能基因检测方法的构建，在分子生物学、生物分析化学以及医学检测等研究领域有潜在的应用价值。