本发明涉及一种跨国产ARM和MIPS CPU体系架构的风电机组控制系统，采用双CPU架构，包括主CPU及从CPU；其中，所述主CPU基于国产ARM架构，负责主控功能，用于运行工控PLC程序实现对整个设备进行监控和管理调度；所述从CPU基于国产MIPS架构，负责智能控制，用以实现包括网络通讯，远程访问，高级语言编程，人机交互界面，优化算法在内的高级功能；所述主CPU与从CPU之间通过双口RAM连接，用于双CPU的快速数据通信，以保障各自的工作节拍不发生干扰；所述主CPU端设有以太网接口，用于数据的远程传输。本发明能够提高风电机组控制系统的安全性和可靠性，提高风电主控系统的运转效率。