本申请涉及一种空气预热器防堵灰的自动控制方法和系统，其中，该方法包括：在火电机组的启动阶段中，监测锅炉侧的脱硝反应器入口烟气温度、监测锅炉侧的喷氨门开度；根据脱硝反应器入口烟气温度和喷氨门开度，通过锅炉侧的空气预热器进行预热；在火电机组的低负荷运行阶段中，对空气预热器冷段元件温度进行监测，得到冷段元件的温度实测值；根据冷段元件的温度实测值和冷段元件的温度预设值，控制空气预热器的热一次风再循环调节门的开度，以防止空气预热器出现低温腐蚀。通过本申请，解决了如何高效准确地防止空预器发生低温腐蚀的问题，实现了在多工况下控制空预器冷段温度，有效预防温度过低产生低温腐蚀、过高影响机组经济性的情况发生。