本发明公开了一种浮游生物稳定同位素样品采集装置，涉及样品采集领域，包括外壳，外壳上对称设置进入口和排出口，排出口处设有取样组件，外壳内部设有安装腔，外壳上设有固定杆，固定杆位于安装腔内的端部上设有转动组件，转动组件上设有若干个固定件，每个固定件的中部均固定连接有储存组件，储存组件包括浮游动物取样筒、浮游植物取样筒、三个密封组件和四个连接部。本发明在采集过程中无需移动，既节能环保，也便于控制采样深度，此外能够连续对不同的采集点进行样品采集，采集效率高，本发明还能够将采集到的浮游动物和浮游植物分离，方便后续对样品进行处理。