本申请公开了一种代码文件合并方法及装置、存储介质、计算机设备，该方法包括：获取待合并的多个初始代码文件，并按照目标排列属性分别对每个初始代码文件中的数组进行排列，获得中间代码文件；针对每个中间代码文件，基于中间代码文件中的代码嵌套关系，将同一个嵌套中的代码平铺在同一级中，形成中间代码文件对应的平铺代码文件；对多个中间代码文件各自对应的平铺代码文件进行逐级比对，标记多个平铺代码文件的各级代码中的差异化代码，并基于差异化代码对应的初始代码文件的文件编辑信息，确定每级差异化代码中的目标代码；基于目标代码对平铺代码文件进行合并得到合并代码文件，对合并代码文件进行反向组装获得目标代码文件。