本发明提出了一种企业合规风险识别与预警管理方法及系统，涉及企业运营领域。其包括采集并评价企业运营信息是否合规；供负责人员将不合规信息进行改进，改进后管理人员对改进内容进行风险评估；利用评估结果判断是否将改进任务进行重新分配，改进后再次进行风险评估；进行一次或多次改进后，比较任意两次改进内容，根据评估结果分析区别内容的影响权重；采集多组企业运营信息、多个区别内容以及各区别内容的影响权重；多组数据通过机器学习训练得到企业风险模型，企业风险模型用于输出企业运营数据的多个区别内容以及影响权重。本发明实现了企业合规风险的识别和预警，解决了企业风险管理成本较高和耗时较长的问题。