本发明公开了一种基于数据处理的审计数据在线稽查方法及系统，包括：若判断目标文本达到履行审计的审计要求，则调取预先设置的履行审计表，根据目标文本、履行审计表确定相应的履行规则信息；遍历第一用户所对应的办公自动化系统中的所有审批流程信息，若判断不存在与目标文本对应的审批流程信息，则输出第一履行审计信息；若判断存在与目标文本对应的审批流程信息，则将对应的审批流程信息与履行规则信息比对，若判断审批流程信息与履行规则信息相对应，则输出第二履行审计信息；若判断审批流程信息与履行规则信息不对应，则将审批流程信息与履行规则信息比对得到履行差异信息，根据履行差异信息输出第一提醒信息。