本申请涉及数据通讯领域，尤其涉及一种通讯通道控制方法、系统、网关和存储介质，应用于网关，所述网关通过至少2个通讯通道与通讯设备连接，所述方法包括：初始化每个通道对应的报文计数值和报文错误计数值；每检测到相应通道接收到数据报文时，则将相应通道的所述报文计数值加一，并对所述数据报文进行合法性验证；当所述数据报文的合法性验证不通过时，则将所述相应通道的报文错误计数值加一；满足预设条件时，基于对应通道的所述报文计数值和所述报文错误计数值，确定对应通道的初始误码率；基于所有通道的所述初始误码率进行主备通道配置。本申请可以通过检测计算多个通道的误码率自动进行切换，能提高系统传输数据的实时性和准确性。