本发明提供一种构筑护顶层回采水体下近水平薄矿体的采矿方法，属于采矿技术领域。该方法首先在地表水体垂直投影面之外布置主运输巷道，并布置辅运输巷道连通两侧主运输巷道，以辅运输巷道划分矿块，在矿块中布置条形矿柱和矿房，以辅运输巷道为钻注自由空间，沿条形矿柱开辟注浆孔钻注空间，并进行锚喷加固；然后根据注浆衍生仿真系统确定出的注浆孔参数、布孔规格和注浆压力参数进行钻孔以及高压注浆工作，待注浆孔浆液扩散凝固之后进行下一步矿石回采工作。该方法利用注浆加固技术在矿体顶部构筑护顶层以提高顶柱抗弯、防渗等性能，实现安全高效开采近水平薄矿体，工艺简单且对距水体较近矿体的回采具有明显的适用性。