本发明为基于水下信标的海底电缆故障定位系统，包括首端接地箱、电流互感器、水下信标、防压盒、末端接地箱、电流采集器和脉冲信号接收器；首端接地箱和末端接地箱分别与海底电缆的首端和末端连接，首端接地箱与地面变电站或地面通讯设备连接，末端接地箱与海上平台的地面电缆连接；靠近海底电缆首端的三相电力线路上分别安装有电流互感器，电流互感器与电流采集器连接；海底电缆上间隔安装有多个防压盒，每个防压盒内均插装有水下信标，水下信标通电向脉冲信号接收器发送脉冲信号，脉冲信号接收器将脉冲信号传输至上位机；防压盒内安装有感应取能模块和化学电池，电缆正常时感应取能模块为水下信标供电，发生故障时化学电池为水下信标供电。通过电流互感器和水下定位信标协同工作的方式，精准定位故障位置。