本发明提供了一种基于串并联结构光伏组件的逆跟踪角度优化方法及其应用的光伏支架控制系统，逆跟踪角度优化方法适用于包括多排串并联结构光伏组件的光伏系统，每一排光伏组件在不超过第一面积被遮挡的情况下，至少除第一面积以外的部分仍可以以正常发电效率工作，逆跟踪角度优化方法包括切换执行第一优化方法和第二优化方法，第一优化方法包括控制每一排光伏组件最多遮挡该排光伏组件后一排的光伏组件中面积为第一面积的部分；第二优化方法包括控制每相邻两排光伏组件之间不遮挡。本发明所提供的一种基于串并联结构光伏组件的逆跟踪角度优化方法相较于现有技术中通过调小支架角度以减少阵列间阴影遮挡的方式可以有效提升逆跟踪阶段发电量。