本申请涉及一种智能库房管理方法及系统，其包括：获取补货任务，所述补货任务包括待补货药品的种类和数量；根据所述补货任务和预设的每种药品在药品架上摆放的位置信息，得到每种药品的补货指令；获取每种药品摆放到药品架后的补货反馈信息、运货机器人运载的剩余任务量和剩余药品信息；根据所述补货反馈信息、运货机器人运载的剩余任务量和剩余药品信息，判断当前补货进程是否正常；若补货进程异常，则停止补货，并生成错误报告。本申请具有提高药品自动补货准确性的效果。