本发明涉及生物医药纯化技术领域，具体为一种鸭胆来源的鹅去氧胆酸中清除别鹅去氧胆酸的方法，所述方法包括以下步骤：S1、将鸭胆来源的鹅去氧胆酸溶于无水乙醇中；S2、向溶液中加入无水乙酸钠，溶解后控温搅拌结晶；S3、抽滤分离得结晶物和结晶母液；S4、结晶物加水和氢氧化钠加热溶解后，加热回收残留溶剂后再冷却酸化，脱水后抽滤分离，烘干；S5、结晶母液经回收乙醇后得到有效物料，加水和氢氧化钠溶解后再冷却酸化，脱水后抽滤分离，烘干，得到的鹅去氧胆酸中别鹅去氧胆酸纯度低于0.5％。