本发明公开了一种补种摆臂式作业定位方法，包括以下步骤：(1)蔗苗识别部分；(2)双目测距部分；(3)漏种位置定位部分；(4)蔗苗动态追踪部分。本发明方法基于两级相机漏种定位策略，既能够保证机器运作的实时性，又能够保证补种的精准性，同时能够对落种质量进行监测。基于蔗苗动态追踪策略，能够关联视频前后帧，保证蔗苗位置信息不会丢失，提升了漏种定位的准确性。运用嵌入式设备将蔗苗特征网络模型、蔗苗位置信息及深度信息进行整合，并充当控制设备对机械臂进行控制。提供的控制系统，减少摆臂回调时间的机制，使得补种作业效率大大提升。