本发明提供一种心脑清制剂及其制备方法，属于中药制剂技术领域，所述制备方法是取海藻酸钠溶于水，得海藻酸钠溶液；取β‑环糊精与氯化钙溶于水，所得固化液中加入红花油、冰片、维生素E、维生素B6和单甘脂分散，再滴加海藻酸钠溶液，所得包埋物溶液经冷冻干燥，即得心脑清微胶囊；所述心脑清微胶囊即为所述心脑清制剂。本发明通过选择特定用量的辅料，利用β‑环糊精、海藻酸钠和氯化钠相互配合，形成稳定的包埋结构，成功将芯材包埋至β‑环糊精内部，再在β‑环糊精外部交联形成凝胶骨胶，有效防止制备的心脑清微胶囊中的芯材泄露。