本发明公开了一种不同采收月份唐古特大黄药材的多元红外光谱判别方法、系统、存储介质及终端，包括：在同一种红外谱图下比较不同月份样品的红外光谱特征，得到光谱特征判别结果；分别在不同的红外谱图下建立判别模型；训练得到不同红外谱图下对应的最优判别模型；利用不同的最优判别模型分别进行判别，并结合所述光谱特征判别结果选定判别效果最好的红外谱图及其对应的最优判别模型。本发明通过采集不同月份药材多种不同的光谱信息，在分析其红外光谱特征的基础上，建立了多种红外光谱信息下的不同采收月份大黄药材判别模型，籍此实现对不同采收月份唐古特大黄的快速判别，为指导唐古特大黄药材采收及后续的生产实践活动提供科学依据。