本发明提出了一种认定电能表时钟故障的方法、装置及系统，涉及电变量测量领域。智能电表和集中器记录校时事件信息、校时故障事件信息、掉电事件信息、电池欠压事件信息和主站校时事件信息，主站定期或在智能电表的冻结数据发生异常时，召测上述事件信息，判断故障原因。采用本发明提出的技术方案，在智能电表出现时钟偏差故障时，根据智能电表和集中器记录的事件信息进行综合判断，进一步确定出现偏差故障的原因，减少误判，提高后续维护效率；在原有系统基础上可方便地对系统进行升级，不增加硬件成本。