本发明涉及农业及环境微生物技术领域，提供了一种阻控小麦吸收重金属的土壤杆菌，所述土壤杆菌为菌株NJ20，保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏编号CGMCC No.26197。本发明还提供了一种菌剂，采用上述土壤杆菌制备而成。所述土壤杆菌及其菌剂用于在重金属污染土壤中阻控小麦吸收重金属。本发明菌株NJ20能在重金属铅和镉胁迫下良好生长，并能吸附去除培养液中可溶性铅和镉；同时，能产生吲哚乙酸，对难溶性磷酸三钙具有较好的溶解作用，改善土壤磷素营养；在重金属污染土壤接种本发明菌株，能有效阻控小麦吸收重金属铅和镉，降低重金属转移系数，减少小麦籽粒和秸秆中铅和镉含量。