本公开涉及一种新旧工程桩基综合处理方法。该方法包括：根据旧桩设计图纸创建第一旧桩BIM三维模型；根据新桩设计图纸建立新桩BIM三维模型；将第一旧桩BIM三维模型和新桩BIM三维模型进行合模；确定发生冲突的第一旧桩和新桩；根据所述第一旧桩BIM三维模型，对新桩BIM三维模型中的新桩进行位置调整；在施工场地，进行每个新桩的打桩施工之前，探测每个新桩处是否有隐藏的第二旧桩；将第二旧桩BIM三维模型和新桩BIM三维模型进行合模；根据第二旧桩BIM三维模型，对新桩BIM三维模型中的新桩进行位置调整；在施工现场，根据新桩的调整位置，进行新桩的打桩施工。有利于避免在施工的过程当中，发现新旧桩冲突而导致的工程延误，有助于提高施工效率。